获得荣誉President’s List, NSERC Doctoral Prize (1994)国家杰出青年基金The Croucher Foundation Senior Fellow Award（2003）中国科学院生命科学和医学学部院士（2011）2006年，构建神经系统信号传导复合体的结构基础，国家自然科学奖二等奖（唯一获奖者）2011年获何梁何利基金科技进步奖[4]
主要成就
科研综述
张明杰系统研究了架构蛋白在构建神经信号转导复合物中的功能及分子机理；提出了多结构域蛋白质中各结构域相互作用形成蛋白质超结构域的概念；发现PDZ结构域与细胞膜上磷脂相互作用，并阐明了这些相互作用的功能意义；对蛋白质-蛋白质，蛋白质-磷脂的相互作用在神经细胞极性形成，细胞不对称性分裂，囊泡传输与融合，神经细胞信号转导等神经生物学重要问题中所起的作用作了系统深入的研究；研究了一系列由于遗传突变所导致的中枢及周边神经系统疾病的发病机理。[4]
张明杰的调控神经细胞信号传递的蛋白质的结构和功能的研究成果，对于治疗神经系统衰退的疾病，如中风及老年痴呆症等，有着极为重要的影响。张教授及其研究小组运用核磁共振技术，从传统中药中筛选活跃分子，抑制神经信号传递中的一氧化氮合成，以发掘具潜质的药物先导化合物，治疗中风疾病。
1998年利用核磁共振技术解出神经元一氧化氮合成酶的一个抑制蛋白的三维结构，次年又解出神经元一氧化氮合成酶一个重要区域与另一种蛋白形成的复合物的三维结构，一氧化氮合成酶含有的PDZ结构域在许多蛋白质相互作用中起重要作用，解出这个区域与其他蛋白结合的结构，对于生物化学领域有着重要的意义。
2001年与其他生物学专家紧密合作，在细胞生物学方面取得重大突破，首次破解了一种对于确保细胞正常运作至关重要的蛋白质(Ykt6p)的三维结构与功能之间的关系。
学术论著
1.Zhang,M. , Tauaka, T, and Ikura,M.(1995)Nat.struct.Biol 2 7582.Tochio. H. , oki,s.,Zhang ,Q,and Zhang,M.(1998)Nat struct.Biol 5 9653. Tochio. H.zhang.Q,MandM.and Zhang,M.(1999) Nat struct.Biol 6 4174.Tochio,H..Tsui,M.,Banfield,D. and Zhang,M.(2001) Science 293,6985.Zhang ,M. and Wang,w.(2003) Acc.chem..Res.36 5306.Feng. W.,Shi,Y.,Li,M. and Zhang. M,(2003) Nat.struct.Biol 10 972学术交流
张明杰在开展NMR研究的过程中，与中国科学院武汉物理与数学研究所一直保持着密切的合作关系。 2003年10月参加了中国分析测试协会(CAIA)主办北京分析测试学术报告会及展览会(BCEIA)，2004年6月参加了武汉物理与数学所举办的“第二届磁共振新技术——生物大分子NMR国际研讨会”。
人才培养
张明杰对年轻人说，兴趣和坚持是成功的关键，把自己感兴趣的事情专心做下去，必有成就。他认为，现在年轻人选择专业、选择工作，比较喜欢赶潮流。实际上，只要认准一个自己感兴趣的专业，做出成就来，就会赢得尊重。所以年轻人要有远大的理想，把创造别人没有做过的东西作为最大的目标，能够获得成功就是最大的幸福
社会任职时间担任职务2005年中国科学院海外评审专家2018年12月宁波大学客座教授?人物评价张明杰在材料科学及生物化学领域进行的基础研究及做出的贡献。（2003年裘槎优秀科研者奖评）[2]
