北京师范大学教育科学研究所六五至九五期间先后承担各级各类有关基础教育方面的科研课题50多项中，(其中省部级以上课题40多项，国际合作项目3项。)既有探讨教育基本理论问题的基础性研究，也有对中小学教育具有实践指导意义的应用性研究，具体内容涉及：师范教育研究，五四学制、课程、教材及教法研究，德育及家庭教育研究，农村教育改革研究、学科教育研究，现代教学论研究，跨世纪基础教育课程改革研究等。
其中阎金铎教授主持的“五四学制成套系列教材建设与实验”、裴娣娜教授主持的“现代教学论发展的理论与实验研究”，参与实验研究的地区、学校、人员众多，成果显著，影响广泛;赵忠心教授在家庭教育领域的开拓性研究，成绩卓著，在全国处于领先地位。
目前在研的省部级以上十五规划课题近20项，其中重点课题7项。裴娣娜教授主持的“主体教育与我国基础教育现代化发展的理论与实验研究”、“首都现代化进程的学校社区教育一体化发展研究”是国家重点和北京市重大项目，体现了本所科学研究与国家和地区发展需要紧密结合的方向和特色。
研究成果及研究成果获奖情况：
出版著作（含教材、工具书、译著）150多部，发表论文460余篇。
五四学制系列教材共编制小学初中计21个学科，153册课本，153册教参以及配套的题集、图册录音磁带，累计印数达7千万册。有20多项成果获得各级各类奖励，其中获省部级一等奖的有:
裴娣娜：少年儿童主体性发展实验研究，获1996年度全国师范院校基础教育改革实验研究项目优秀成果一等奖(教育部);
赵忠心：家庭教育学，获1996年北京市第四届哲学社会科学优秀成果一等奖；裴娣娜等：教学论学科建设，获1997年北京市普通高校教学成果一等奖;
刘坚：21世纪中国数学教育展望，获1998年全国第二届中青年哲学社会科学成果奖（最高奖）(社科院);
刘坚：21世纪中国数学教育展望—大众数学的理论与实践，获1997年度全国师范院校基础教育改革实验研究项目优秀成果一等奖(教育部)。
学术交流：
100多人次参加国内及美国、日本、韩国与香港、澳门、台湾等国家、地区召开的各种学术会议，提交论文数十篇。
150多人次应邀为国内各高校、学术会议、社区团体及港澳地区讲学或学术报告。 20人次赴美国、日本、泰国及香港地区学习或考察。
20多人次与加拿大、韩国、日本、香港、澳门地区开展合作研究。邀请日本、香港、台湾等国家和地区学者8人次来研究所讲学。
近年召开的学术研讨会:
1997年8月26—28日，与港大教育学院联合召开“华人地区面向21世纪基础教育课程与教学改革”研讨会;
2000年6月，与教育部发展中心联合召开“国际数学课程改革”高级研讨会；
2001年7月16—19日，与港大教育学院联合召开“基础教育科学素养与科学教育国际会议首届研讨会--21世纪科学教育：迎接新世纪的挑战”。
2001年12月14—16日，与澳门教育局联合召开“内地澳门中小学数学课程改革”学术研讨会。
主要刊物：
《学科教育》杂志，月刊，公开发行，国内统一刊号CN11—2548/G4,国际标准刊号ISSN1002—5308,邮发代号82—669。
《学科教育》创刊于1988年，1995年被教育部基础教育司列为基础教育司教学指导性刊物。主要面向中小学校长和教务主任、各级教研员、教育行政管理干部以及中小学教师，旨在宣传教育部有关基础教育改革与发展的方针、政策：交流课程改革试验区及各地的教学改革成果：研究中小学学科教育的规律，为指导全国基础教育改革，提高各科教学质量服务。
《学科教育》杂志1999年12月被“中国科学文献计量研究中心”认定为《中国人文社会科学引文数据库》来源期刊和《中国学术期刊综合评价数据库》来源期刊。2000年被新闻出版署确定为教育类核心期刊，列入《中文核心期刊要目总览》。
现任主编阎金铎、陈建翔。
